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  Transitions in a genetic transcriptional regulatory system under Lévy motion

Zheng, Y., Serdukova, L., Duan, J., & Kurths, J. (2016). Transitions in a genetic transcriptional regulatory system under Lévy motion. Scientific Reports, 6:. doi:10.1038/srep29274.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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7276oa.pdf (出版社版), 2MB
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7276oa.pdf
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作成者

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 作成者:
Zheng, Y.1, 著者
Serdukova, L.1, 著者
Duan, J.1, 著者
Kurths, Jürgen2, 著者              
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Potsdam Institute for Climate Impact Research, ou_persistent13              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Based on a stochastic differential equation model for a single genetic regulatory system, we examine the dynamical effects of noisy fluctuations, arising in the synthesis reaction, on the evolution of the transcription factor activator in terms of its concentration. The fluctuations are modeled by Brownian motion and α-stable Lévy motion. Two deterministic quantities, the mean first exit time (MFET) and the first escape probability (FEP), are used to analyse the transitions from the low to high concentration states. A shorter MFET or higher FEP in the low concentration region facilitates such a transition. We have observed that higher noise intensities and larger jumps of the Lévy motion shortens the MFET and thus benefits transitions. The Lévy motion activates a transition from the low concentration region to the non-adjacent high concentration region, while Brownian motion can not induce this phenomenon. There are optimal proportions of Gaussian and non-Gaussian noises, which maximise the quantities MFET and FEP for each concentration, when the total sum of noise intensities are kept constant. Because a weaker stability indicates a higher transition probability, a new geometric concept is introduced to quantify the basin stability of the low concentration region, characterised by the escaping behaviour.

資料詳細

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 日付: 2016
 出版の状態: Finally published
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/srep29274
PIKDOMAIN: Transdisciplinary Concepts & Methods - Research Domain IV
eDoc: 7276
Working Group: Network- and machine-learning-based prediction of extreme events
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Scientific Reports
種別: 学術雑誌, SCI, Scopus, p3, OA
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 6 通巻号: 29274 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): CoNE: https://publications.pik-potsdam.de/cone/journals/resource/journals2_395