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  AI-guided few-shot inverse design of HDP-mimicking polymers against drug-resistant bacteria

Wu, T., Zhou, M., Zou, J., Chen, Q., Qian, F., Kurths, J., Liu, R., & Tang, Y. (2024). AI-guided few-shot inverse design of HDP-mimicking polymers against drug-resistant bacteria. Nature Communications, 15:. doi:10.1038/s41467-024-50533-4.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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wu_2024_s41467-024-50533-4.pdf (出版社版), 65MB
ファイル名:
wu_2024_s41467-024-50533-4.pdf
説明:
-
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MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf / [MD5]
技術的なメタデータ:
著作権日付:
-
著作権情報:
-

作成者

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 作成者:
Wu, Tianyu1, 著者
Zhou, Min1, 著者
Zou, Jingcheng1, 著者
Chen, Qi1, 著者
Qian, Feng1, 著者
Kurths, Jürgen2, 著者              
Liu, Runhui1, 著者
Tang, Yang1, 著者
所属:
1External Organizations, ou_persistent22              
2Potsdam Institute for Climate Impact Research, ou_persistent13              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Host defense peptide (HDP)-mimicking polymers are promising therapeutic alternatives to antibiotics and have large-scale untapped potential. Artificial intelligence (AI) exhibits promising performance on large-scale chemical-content design, however, existing AI methods face difficulties on scarcity data in each family of HDP-mimicking polymers (<102), much smaller than public polymer datasets (>105), and multi-constraints on properties and structures when exploring high-dimensional polymer space. Herein, we develop a universal AI-guided few-shot inverse design framework by designing multi-modal representations to enrich polymer information for predictions and creating a graph grammar distillation for chemical space restriction to improve the efficiency of multi-constrained polymer generation with reinforcement learning. Exampled with HDP-mimicking β-amino acid polymers, we successfully simulate predictions of over 105 polymers and identify 83 optimal polymers. Furthermore, we synthesize an optimal polymer DM0.8iPen0.2 and find that this polymer exhibits broad-spectrum and potent antibacterial activity against multiple clinically isolated antibiotic-resistant pathogens, validating the effectiveness of AI-guided design strategy.

資料詳細

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言語: eng - 英語
 日付: 2024-07-262024-07-26
 出版の状態: Finally published
 ページ: 22
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1038/s41467-024-50533-4
PIKDOMAIN: RD4 - Complexity Science
Organisational keyword: RD4 - Complexity Science
Research topic keyword: Nonlinear Dynamics
Model / method: Machine Learning
Model / method: Nonlinear Data Analysis
MDB-ID: No MDB - stored outside PIK (see locators/paper)
OATYPE: Gold Open Access
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Nature Communications
種別: 学術雑誌, SCI, Scopus, p3, oa
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 15 通巻号: 6288 開始・終了ページ: - 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): CoNE: https://publications.pik-potsdam.de/cone/journals/resource/journals354
Publisher: Nature